[1]黄徐骏,李海波,陈友吾,等.基于多重荧光SSR标记鉴别榧树品种(品系)[J].浙江林业科技,2021,41(06):24-29.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2021.06.004]
 HUANG Xu-jun,LI Hai-bo,CHEN You-wu,et al.Identification of Cultivars of Torreya grandis Cultivars (Strains) by Multiple Fluorescent SSR Markers[J].Journal of Zhejiang Forestry Science and Technology,2021,41(06):24-29.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2021.06.004]
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基于多重荧光SSR标记鉴别榧树品种(品系)()
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《浙江林业科技》[ISSN:1001-3776/CN:33-1112/S]

卷:
41
期数:
2021年06期
页码:
24-29
栏目:
出版日期:
2021-12-10

文章信息/Info

Title:
Identification of Cultivars of Torreya grandis Cultivars (Strains) by Multiple Fluorescent SSR Markers
文章编号:
1001-3776(2021)06-0024-06
作者:
黄徐骏1李海波2陈友吾2叶碧欢2宋其岩2胡传久2沈建军2廖荣俊3
(1. 遂昌县妙高林业工作中心站,浙江 遂昌 323300;2. 浙江省林业科学研究院,浙江杭州 310023;3. 衢州市林业科技推广站,浙江 衢州 324002)
Author(s):
HUANG Xu-jun1LI Hai-bo2CHEN You-wu2YE Bi-huan2SONG Qi-yan2HU Chuan-jiu2SHEN Jian-jun2LIAO Rong-jun3
(1. Suichang Miaogao Forestry Work Center Station of Zhejiang, Suichang 323300, China; 2. Zhejiang Academy of Forestry, Hangzhou 310023, China; 3. Quzhou Forestry Science and Technology Extension Station of Zhejiang, Quzhou 324002, China)
关键词:
榧树SSR标记分子鉴别基因型多重PCR
Keywords:
Torreya grandis SSR marker molecular identification genotype multiplex PCR
分类号:
S791.53
DOI:
10.3969/j.issn.1001-3776.2021.06.004
文献标志码:
A
摘要:
榧树Torreya grandis品种的准确鉴别对于新品种的选育与知识产权保护具有重要意义。为了建立高效鉴别榧树品种的分子技术手段,以9个榧树品种(品系)作为研究材料,通过对前期‘细榧’品种的转录组测序数据进行SSR标记筛选以获得可稳定扩增的品种(品系)间多态性SSR标记,从而揭示9个榧树品种(品系)间的基因型差异;进一步利用多重荧光SSR标记技术将多个多态性SSR标记整合,基于基因型组合的差异来高效鉴别榧树品种(品系)。结果表明,9个榧树品种(品系)的基因组DNA在SSR位点Tg_U7和Tg_U734可扩增出4种不同的基因型组合,分别为289/295和192/222、277/295和192/222、277/289/295和192/216/222以及277/295和192/216,可一次性将榧树中的‘玉山鱼榧’‘磐大榧’(品种)和大丁香(品系)鉴别出来。本研究结果表明基于多重荧光SSR标记技术的基因型组合差异可作为榧树品种(品系)特异性的SSR指纹,为榧树材料的鉴别提供了高效便捷的分子技术手段。
Abstract:
In November 2020, fresh tender leaves were collected from 6 cultivars and 3 strains (3 trees each) of Torreya grandis in Pan’an county, Zhejiang province for identification experiment. SSR markers were screened according to the previously established transcriptome database of a T. grandis ‘Xifei’ in order to obtain polymorphic SSR markers. These polymorphic SSR markers were further used for detect genotypic difference among 9 materials. The multiplex PCR assays were further established for the joint use of these polymorphic SSR markers for identifying cultivars and strains based on different genotype combinations. The results showed that 4 genotypes combinations including 289/295 plus 192/222, 277/295 plus 192/222, 277/289/295 plus 192/216/222, and 277/295 plus 192/216 were detected from two polymorphic SSR loci of Tg_U7 and Tg_U734 for 9 materials. The different genotype combinations allowed to identify simultaneously 2 cultivars and 1 strain of T. grandis, namely ‘Yushanyufei’, ‘Pandafei’ and Dadingxiang strain.

参考文献/References:

[1] 郑万钧,傅立国. 中国植物志:第7卷[M]. 北京:科学出版社,1978:459.
[2] 程晓建,黎章矩,喻卫武,等. 榧树的资源分布与生态习性[J]. 浙江林学院学报,2007,22(4):383-388.
[3] 刘浩凯,胡树恒,董雷鸣,等. 雌性榧树4个居群遗传多样的SRAP分析[J]. 经济林研究,2014,32(3):30-35.
[4] 黎章矩,程晓建,戴文圣,等. 香榧品种起源考证[J]. 浙江林学院学报,2005,22(4):443-448.
[5] 王辉,陈力耕,童品璋. 香榧的适应性及其栽培技术[J]. 中国南方果树,2005,34(6):42-44.
[6] 陈力耕,王辉,童品璋. 香榧的主要品种及其开发价值[J]. 中国南方果树,2005,34(5):33-34.
[7] 谭晓风,胡芳名,张党权,等. 香榧主要栽培品种的RAPD分析[J]. 园艺学报,2002,29(1):69-71.
[8] 陈红星,李公荣,张苏炯. 香榧新品种‘磐安长榧’的选育[J]. 果树学报,2020,37(2):297-300.
[9] 陈红星,唐海英,张苏炯. 香榧新品种‘玉山鱼榧’的选育[J]. 果树学报,2020,37(5):779-782.
[10] 陈红星,曹兆平,黄银德,等. 榧树种实特大型品种(系)种实性状比较研究[J]. 浙江林业科技,2021,41(4):1-9.
[11] 叶生月,陈钢,张慧,等. 香榧ISSR-PCR扩增条件的优化和引物筛选[J]. 浙江林学院学报,2010,27(1):87-92.
[12] 戴正,陈力耕,童品璋,等. 香榧品种遗传变异与品种鉴定的ISSR分析[J]. 园艺学报,2008,35(8):1125-1130.
[13] 沈登锋,付秋华,骆成方,等. 榧树变异类型的初步研究[J]. 林业科技开发,2014,28(2):68-71.
[14] 董雷鸣. 榧树群体遗传结构及与苗期生长性状关联的SRAP标记分析[D]. 杭州:浙江农林大学,2013.
[15] 刘浩凯. 榧树遗传多样性的SRAP标记分析[D]. 杭州:浙江农林大学,2014.
[16] 罗冉,吴委林,张旸,李玉花. SSR分子标记在作物遗传育种中的应用[J]. 基因组学与应用生物学,2010,29(1):137-143.
[17] 李海波,丁红梅,陈友吾,等. 12个油茶品种的SSR特征指纹鉴别[J]. 中国粮油学报,2017,32(10):171-178.
[18] 李益,马先锋,唐浩,等. 柑橘品种鉴定的SSR标记开发和指纹图谱库构建[J]. 中国农业科学,2018,51(15):149-159.
[19] 王瑞,张福耀,程庆军,等. 利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱[J]. 作物学报,2015,41(4):658-665.
[20] 黄平,崔鹏娇,郑勇奇,等. 基于SSR标记月季品种鉴定及遗传关系分析[J]. 林业科学,2012,48(10):55-62.
[21] 冯锦霞,张川红,郑勇奇,等. 利用荧光SSR标记鉴别杨树品种[J]. 林业科学,2011,47(6):167-174.
[22] YI G,ZHAO T,YIN Z,et al. Mining and characterizing EST-SSR markers from ESTs of Torreya grandis[J]. Biochem Syst Ecol,2016,65:124-128.
[23] 张敏,周彩红,陈焘,等. 榧树转录组SSR信息分析及其分子标记开发[J]. 果树学报,2017,34(10):1258-1265.
[24] 周彩红. 基于RNA-seq的‘细榧’高含油量分子机制初探及SSR标记开发[D]. 杭州:浙江农林大学,2017.
[25] CHAMBERLAIN J S,GIBBS R A,RAINER J E,et al. Deletion screening of the duchenne muscular dystrophy locus via multiplex DNA amplification[J]. Nucl Acid Res,1988,16(23):11141-11156.
[26] 汪国云,周剑,沈禹彤,等. 应用多重荧光SSR标记组合鉴定杨梅果实的品种来源[J]. 中国南方果树,2014,43(3):15-18.
[27] 夏春兰,方清建,付存念,等. 玉米简易多重SSR-PCR和荧光标记检测技术[J]. 分子植物育种,2015,13(9):2095-2099.
[28] 李海波,王珊,丁红梅,等. 普通油茶转录组EST-SSR分子标记开发[J]. 植物生理学报,2017,53(7):1267-1278.
[29] 陈友吾,廖荣俊,叶碧欢,等. 多花黄精转录组SSR位点分析及分子标记开发[J]. 中草药,2020,50(1):182-189.
[30] 麻丽颖,孔德仓,刘华波,等. 36份枣品种SSR指纹图谱的构建[J]. 园艺学报,2012,39(4):647-654.
[31] 匡猛,杨伟华,许红霞,等. 中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析[J]. 中国农业科学,201l,44(1):32-36.
[32] 黄婷,马啸,张新全,等. 多花黑麦草DUS测定中SSR标记品种鉴定比较分析[J]. 中国农业科学,2015,48(2):381-389.
[33] SCHUELKE M. An economic method for the fluorescent labeling of PCR fragments[J]. Nat Biotechnol,2000,18(2):233-234.
[34] 金群英,徐燕丽,叶华琳,等. TP-M13自动荧光法的改进及在美国山核桃品种鉴定上的应用[J]. 浙江林业科技,2015,35(5):41-46.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2021-08-06;修回日期:2021-10-21
基金项目:中央财政林业科技推广示范资金项目“浙江省新发展木本油料质量安全控制与资源化综合利用技术推广示范”(项目编号〔2021〕TS16号);浙江省省院合作林业科技项目“香榧重要病虫害综合防控技术研究”(项目编号2019SY09)
作者简介:黄徐骏,工程师,从事森林培育与资源保护工作;E-mail:15205786685@qq.com。通信作者:廖荣俊,工程师,从事经济林栽培技术推广工作;E-mail: 404372610@ qq.com。
更新日期/Last Update: 2021-12-01