[1]张明哲,尹文秀,陈哲,等.基于单核苷酸多态性位点的土沉香物种鉴定[J].浙江林业科技,2018,38(06):29-32.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2018.06.005]
 ZHANG Ming-zhe,YIN Wen-xiu,CHEN Zhe,et al.Identification of Aquilariasinensis by Single Nucleotide Polymorphism[J].Journal of Zhejiang Forestry Science and Technology,2018,38(06):29-32.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2018.06.005]
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基于单核苷酸多态性位点的土沉香物种鉴定()
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《浙江林业科技》[ISSN:1001-3776/CN:33-1112/S]

卷:
38
期数:
2018年06期
页码:
29-32
栏目:
出版日期:
2018-12-20

文章信息/Info

Title:
Identification of Aquilariasinensis by Single Nucleotide Polymorphism
文章编号:
1001-3776(2018)06-0029-04
作者:
张明哲1尹文秀1陈哲1吴姗1虞惠贞1张晓峰1许瑾2李明福2吴蓉1
1. 浙江省检验检疫科学技术研究院,浙江杭州 310016;2. 中国检验检疫科学研究院,北京 100176
Author(s):
ZHANG Ming-zhe1YIN Wen-xiu1CHEN Zhe1WU Shan1YU Hui-zhen1ZHANG Xiao-feng1XU Jin2LI Ming-fu2WU Rong1
1.Zhejiang Academy of Science and Technology for Inspection and Quarantine, Hangzhou 310016, China; 2.Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100176, China
关键词:
土沉香实时荧光PCRITS物种鉴定
Keywords:
Aquilariasinensis Real-time PCR ITS species identification
分类号:
Q949.761.1
DOI:
10.3969/j.issn.1001-3776.2018.06.005
文献标志码:
A
摘要:
对土沉香Aquilariasinensis,云南沉香A.yunnanensis和马来沉香A. malaccensis 3种沉香属Aquilaria植物的ITS序列进行PCR扩增和测序,并通过DNAMAN软件筛选出单核苷酸多态性(SNP)位点,土沉香序列第236位上的碱基为C,而云南沉香和马来沉香为T,设计出土沉香特异性引物AS-F,AS-R和探针AS-P。实时荧光定量PCR实验表明,该引物探针能特异性扩增土沉香,且检测灵敏度可以达到0.01 ng?μL-1,是一种快速、灵敏的鉴定方法。
Abstract:
Leaves were collected and timbers of Aquilariasinensis, A. yunnanensis and A. malaccensis were quarantined from March to July of 2017 from different provinces in China, and were amplified and sequenced. Screening of single nucleotide polymorphisms (SNP) by DNAMAN software, specific primers and probes were designed for. The real-time PCR test showed that the primer and probe could specifically amplify A. sinensis, and the sensitivity reached 0.01 ng?μL-1.

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相似文献/References:

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 LIN Xiao-jia,WU Shan,CHEN Wu-jian,et al.Real-time PCR Identification of Amaranthus spinosus and Amaranthus spp.[J].Journal of Zhejiang Forestry Science and Technology,2018,38(06):44.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2018.02.007]

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2018-05-21;修回日期:2018-09-09 基金项目:国家重点研发计划课题(2017YFF0210304);浙江省重点研发计划项目(2018C02041);浙江省科技厅公益性项目(2017C32045) 作者简介:张明哲,博士,高级农艺师,从事物种鉴定和转基因检测研究;E-mail:mzzhang429@163.com。
更新日期/Last Update: 2018-12-20