[1]林晓佳,吴 姗,陈吴健,等.刺苋和苋属的实时荧光PCR 鉴定[J].浙江林业科技,2018,38(02):44-49.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2018.02.007]
 LIN Xiao-jia,WU Shan,CHEN Wu-jian,et al.Real-time PCR Identification of Amaranthus spinosus and Amaranthus spp.[J].Journal of Zhejiang Forestry Science and Technology,2018,38(02):44-49.[doi:10.3969/j.issn.1001-3776.2018.02.007]
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刺苋和苋属的实时荧光PCR 鉴定()
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《浙江林业科技》[ISSN:1001-3776/CN:33-1112/S]

卷:
38
期数:
2018年02期
页码:
44-49
栏目:
出版日期:
2018-05-31

文章信息/Info

Title:
Real-time PCR Identification of Amaranthus spinosus and Amaranthus spp.
作者:
林晓佳吴 姗陈吴健任 琰沈旭芳
浙江省检验检疫科学技术研究院,浙江 杭州 310016)
Author(s):
LIN Xiao-jiaWU ShanCHEN Wu-jianREN YanSHEN Xu-fang
Zhejiang Academy of Inspection and Quarantine, Hangzhou 310016, China
关键词:
刺苋苋属实时荧光PCR鉴定
Keywords:
Amaranthus spinosus Amaranthus spp. real-time PCR identification
分类号:
Q959.745.2 ;R185
DOI:
10.3969/j.issn.1001-3776.2018.02.007
文献标志码:
A
摘要:
基于叶绿体的PsbA 基因(Genbank 登录号:DQ006133.1),设计了ASP-1 和ASP-2 两组具有刺苋特异性 的引物探针,对苋科Amaranthaceae 苋属Amaranthus 刺苋A. spinosus 的9 个不同地理种、长芒苋A. palmeri 的2 个不同地理种、其它5 种苋属植物和苋科非苋属8 种,以及苋科外植物3 种共27 个样品进行TaqMan 实时荧光 PCR 鉴定。结果表明,ASP-1 适合作为刺苋的实时荧光PCR 鉴定引物,其最佳扩增温度62℃;ASP-2 适合作为 苋属的实时荧光PCR 鉴定,其最佳扩增温度为60℃。首次建立了TaqMan 探针实时荧光PCR 快速鉴定刺苋和苋 属植物的方法。在优化后的检测条件下,ASP-1 的检测灵敏度可达到0.03 ng·μL-1;ASP-2 的检测灵敏度则可达到 0.01 ng·μL-1。上述方法作为形态鉴定的辅助方法,可准确有效的对刺苋及苋属植物进行鉴定。
Abstract:
Based on the conserved fragment of plant chloroplast genes (Genbank No. DQ006133.1), a primer-probe set specific for Amaranthus spinosus (ASP-1) and a primer-probe set specific for Amaranthus spp. (ASP-2) were designed. Screened by to the 27 species including 9 target species, 7 closely-related species and 11 other non-target species,the two primer-probe sets show good specificity. According to the real-time PCR tests results, the optimum amplification temperatures for ASP-1 and ASP-2 are 62℃ and 60℃ separately. Under optimal conditions ASP-1 and ASP-2 showed high efficiency in the detection of target plants with the detection limits of 0.03 ng·μL-1 for A.spinosus and 0.01 ng·μL-1 for Amaranthus spp., respectively. It is the first time to establish a real-time PCR method for rapid identification of Amaranthus spinosus and Amaranthus spp., and as an auxiliary method of morphological identification, it can be implemented accurately and effectively.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2017-09-24;修回日期:2018-02-27 基金项目:质检公益性行业科研专项“外来生物定殖因子及危害因子研究与防控技术”(201410014) 作者简介:林晓佳,高级农艺师,从事进出境植物有害生物检疫鉴定及风险分析工作;E-mail:lxj@ziq.gov.cn。通信作者:吴姗,高级工 程师,从事动植物物种分子鉴定及食品真伪鉴定工作;E-mail:ws@ziq.gov.cn。
更新日期/Last Update: 2018-06-15